Phú Quốc sở hữu nhiều khu nghỉ dưỡng spa đẳng cấp, tập trung dọc các bãi biển dài như Bãi Trường, Bãi Khem và Gành Dầu. Hầu hết là resort 5 sao với bãi biển riêng, hồ bơi vô cực và các liệu trình spa chuyên sâu. Du khách có thể lựa chọn từ những khu nghỉ dưỡng dành cho gia đình với câu lạc bộ trẻ em, đến những nơi lãng mạn dành cho cặp đôi. Giá phòng thường dao động từ vài triệu đến hàng chục triệu đồng mỗi đêm, tùy vào hạng phòng và mùa du lịch.
Nổi bật trong danh sách là JW Marriott Phu Quoc Emerald Bay Resort & Spa (điểm 94) với thiết kế của Bill Bensley và bãi biển Khem riêng. InterContinental Phu Quoc Long Beach Resort gây ấn tượng với HARNN Heritage Spa từng đoạt giải và sky bar INK 360 cao nhất đảo. Regent Phu Quoc (điểm 96) có 5 hồ bơi, spa đích thực và du thuyền riêng. Vinpearl Wonderworld Phu Quoc phù hợp gia đình nhờ gần Vinpearl Land và bãi biển Bãi Dài. Hầu hết resort đều có đưa đón sân bay miễn phí và bữa sáng phong phú.