Phú Quốc có nhiều khách sạn giá rẻ phù hợp cho du khách tiết kiệm. Các khách sạn này chủ yếu tập trung ở Dương Đông, Bãi Trường và gần sân bay, với mức giá từ 200.000 đến 600.000 đồng/đêm. Du khách có thể mong đợi các tiện nghi cơ bản như Wi-Fi miễn phí, điều hòa, và bữa sáng. Nhiều khách sạn có hồ bơi ngoài trời và một số nằm ngay trên bãi biển. Đặt phòng trước để có giá tốt nhất.
Trong số các khách sạn giá rẻ được đánh giá cao, Hawaii Resort Phu Quoc (3 sao) có bãi biển riêng và hồ bơi ngoài trời, phù hợp cho gia đình. Tropicana Resort Phu Quoc (điểm 81) nổi bật với khu vườn nhiệt đới và bungalow mái lá, lý tưởng cho các cặp đôi. Praha Hotel (điểm 86) cung cấp dịch vụ đưa đón sân bay miễn phí và hồ bơi, thích hợp cho khách công tác. Cottage Village (điểm 89) mang không gian yên tĩnh với hai hồ bơi và bữa sáng ngon, phù hợp cho kỳ nghỉ thư giãn. An Phu Hotel (điểm 84) gần chợ đêm Phú Quốc và chùa Sùng Hưng, thuận tiện cho du khách muốn khám phá trung tâm.